澳大利亚研究人员开发了一种技术，用于发现罕见的免疫细胞，这些细胞可以从患者自身的免疫系统中对癌细胞产生反应。
他们将其比作条形码跟踪器，能够一次扫描数千个免疫细胞的详细信息。
“这种方法为我们提供了关于免疫细胞在人体中如何表现的最详细的观点，”Garvan医学研究所的资深作者Chris Goodnow说。
“免疫细胞在疾病的发展中起着关键作用。这种方法显示出巨大的潜力，可以帮助我们个性化癌症治疗个体。“
这项新技术 - 被称为RAGE-seq-- 在Nature Communications 杂志的一篇论文中有所描述。它由Garvan免疫基因组学实验室的Mandeep Singh和肿瘤进展实验室的Ghamdan Al-Eryani开发。
以前的方法已经能够读取从单个细胞中编码免疫细胞受体的长链遗传输出(RNA)，但研究人员说，它没有成功地分析肿瘤中存在的数千个细胞。时间。
他们的方法 - 通过测序的保留曲目和基因表达，使其全名 - 是通过协调四种不同的基因组技术而开发的。
他们首先开发了一种从单细胞中富集RNA的方法，靶向编码免疫细胞受体的RNA，然后开发了一种计算工具来准确读取免疫细胞受体的全长序列。
通过一次“扫描”数千个细胞中的相关免疫细胞受体，RAGE-seq可以提供组织样本中免疫细胞如何相关的准确快照，以及哪些细胞可以有效地产生针对癌症的反应。
在一项原理验证研究中，研究人员使用该方法从乳腺癌患者的肿瘤和相关淋巴结中采集7138细胞。
他们确定了两种组织中存在的许多相关细胞，并揭示了患者肿瘤内免疫反应的特定遗传特征。
他们现在将该技术应用于黑素瘤患者的样本，以了解为什么接受免疫治疗的患者中有一半的反应较差。他们认为同样的方法也可以用于自身免疫和炎症性疾病。