如果在源头(TDS)扣除的税款不足或没有税收，个人需要自己支付赤字金额，以避免从所得税部门获得查询和/或通知。当员工在财政年度内转换工作并且未能从旧雇主那里领取收入证明和/或将其提交给新雇主时，可能会出现TDS较低的情况，导致剩余时间内的税收计算减少。财政年度，因为部分时间的收入被视为全年的收入。
当储蓄账户和/或定期存款(FD)账户的利息收入以及其他来源的收入加入主要收入来源时，也可能需要支付额外税款。
如果应税总收入超过总TDS税，则在提交所得税申报表(ITR)时将显示“纳税”，如果TDS超过实际应纳税额，则将退还。虽然提交可退税的ITR是合理的，但是不应该向ITR提交应付税款，这很可能会吸引IT部门的查询和通知。
如果在提交ITR时需要缴纳税款，您应首先通过Challan ITNS-280支付应付税额，并在ITR中提供Challan的详细信息，以确保在提交申请之日不需要缴纳税款回报。
除个人外，公司还使用Challan ITNS-280支付预付税，自我评估税，定期评估税，附加税，国内公司分配利润税和单位持有人分配收入税 - 如适用 - 在线通过电子支付和离线指定的所有税务部门的银行分行。
所得税有资格获得ITR-1或Sahaj和ITR-4(早期的ITR-4S或Saral)可以使用“准备和在线提交”选项，也可以通过下载和使用准备返回来使用上传XML文件的选项Excel或Java实用程序。对于其他评估者，唯一的选择是uload XML。
虽然只有单一房产的工资收入和收入的人才有资格申请ITR-1，年收入不超过2亿卢比的小纳税人，以及根据第44AD条，第44ADA条和第44B节的推定收入计划选择征税的小纳税人IT法案的44AE，例如 - 涉及租赁，出租或合法购买货物车厢等任何类型的业务，都有资格提交ITR-4(早期的ITR-4S)。
使用“在线准备和提交”选项支付税款和归档申报的步骤
步骤1：在提交ITR-1或ITR-4(早期ITR-4S)时选择“准备并在线提交”，并在必要时填写未预填的部分或修改预填字段的详细信息。
第2步：如果需要缴纳税款，将产生电子缴税税的链接。点击链接即可自动填写Challan ITNS-280。
步骤3：检查预先填写的ITNS-280中的详细信息，并在选择“网上银行”或“借记卡”选项后将其提交给所需的银行，该选项将引导您进入银行页面。
第4步：输入登录详细信息并支付金额。
步骤5：保存成功付款后生成的纳税challan，并在ITR的适当位置填写BSR代码，日期，Challan编号和金额。
第6步：在重新检查没有应付税款后提交退货。
如果需要，所有其他评估者甚至上述评估者都需要下载税务实用程序并在启用宏后填写所有详细信息(如果适用)。
使用Excel或Java实用程序支付税款和归档申报的步骤
步骤1：下载适用的ITR的相关Excel或Java实用程序，在适用的情况下启用宏，并填写所有相关字段。在提供所有信息后，Excel或Java实用程序将计算税额并将其与TDS和纳税详细信息进行比较。检查是否需要缴税。
步骤2：要支付税额，请单击电子邮件站点上的电子支付税链接，然后选择“继续访问NSDL网站”选项。
步骤3：在NSDL页面上，单击“CHALLAN NO./ITNS 280”下的“继续”，这将引导您进入challan页面。
步骤4：在challan页面中，公司必须选择“(0020)公司税(公司)”选项，个人必须选择“(0021)所得税(公司除外)”对“适用税”。
步骤5：从选项(100)预付税中选择“付款方式”; (102)附加税; (106)分配利润税; (107)分配收入税; (300)自我评估税和(400)定期评估税，以适用者为准。
大多数情况下，对于个人所得税纳税人而言，期权可以是(100)预付税，在财政年度支付时，或(300)自我评估税，在财政年度结束后支付。
步骤6：根据选项选择网上银行或借记卡选项和所需的银行，通过该选项支付税款。值得注意的是，几乎所有商业银行都可以通过净银行业务选择支付税款，但目前可以从仅有六家银行的名单中选择一家银行 - 即。Canara银行，HDFC银行，ICICI银行，印度银行，Punjan国家银行和印度国家银行 - 针对借记卡选项。
步骤7：一旦银行被选中，纳税人必须输入他/她的PAN并选择必须支付税款的评估年度。完成该地址后，将在进入银行页面之前填写电子邮件ID，手机号码和验证码。
步骤8：输入登录详细信息后，重新检查银行页面上显示的详细信息，并输入要支付的税额并继续付款。
步骤9：付款后生成税务challan后，在Excel / Java实用程序中的适当位置填写BSR代码，日期，Challan编号和金额。
步骤10：重新检查后无需支付税款后生成XML。
步骤11：在登录到电子网站后提交退货时，选择要上传的XML文件。
所有评估人员必须通过基于Aadhaar的OTP，EVC在线验证返回，或者通过将签署的ITR确认(ITR-V)发送到班加罗尔的所得税CPC办公室来完成ITR备案流程。